A educação profissional visa a formação de profissionais para ação social, terapêutica, cultural e educativa. Os cursos são pautados pela busca de qualidade, a partir da formação integral, solidária, social e ecologicamente responsável.
No nível da educação profissional, a Faculdades EST oferece cursos na área de Artes (Curso Técnico em Música, Especialização - nível médio - em Regência Coral, Cursos de Extensão em Música e Tecnologia, Cursos Livres de Música) e na área de Saúde (Curso Técnico em Enfermagem, Especialização - nível médio - em Geronto-Geriatria e Cursos de Extensão).
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