O curso de Bacharelado em Teologia da Faculdades EST foi o primeiro do Brasil a receber autorização oficial para funcionamento. O curso oferece formação crítico-reflexiva, interdisciplinar, solidária, ética, social e ecologicamente responsável.

A partir da formação acadêmica, da pesquisa, do acompanhamento espiritual, da inserção social, comunitária e educativa, a teóloga e o teólogo são capacitados a interagir no seu contexto para o desenvolvimento espiritual, social e educacional; dialogar com a diversidade e promover o bem-estar integral, a dignidade, os direitos humanos e a cidadania.

A Faculdades EST prepara para o exercício de ministérios eclesiásticos - pastoral, catequético ou diaconal - e para a atuação junto à sociedade civil, como organizações não-governamentais, instituições sociais, educacionais e da área da saúde.

O Ministério da Educação renovou o Reconhecimento do Bacharelado em Teologia da EST, através da Portaria nº 285, de 09 de abril de 2008, publicada no DOU do dia 10 de abril de 2008. Nesta mesma portaria ampliou as vagas anuais de 135 para 205.